测试报告
AMD EPYC Rome VASP 测试
周健 2019.11.18 测试算例 Ruddlesden-Popper 钛酸锶 Sr4Ti3O10，305个原子。 输入文件 SYSTEM = STO PREC=A ENCUT=520 E...
Gromacs
注意：为了保证GPU性能, 在没有特殊要求的情况下，请使用2021版本的Gromacs，并用GPU计算所有的相互作用。没特殊要求的话请看第三部分。 1. Gromacs-2018.8 说明： ...
vasp6 gpu 测试
Gromacs-2021.3 (比较常用GPU队列)
4. Gromacs-2021.3 (比较常用GPU队列) 说明： 使用Singularity容器解决方案，调用/fs00/software/singularity-images/ngc_gro...
Desmond_2022-4在HPC上的表现和批量化MD操作
拳打Amber脚踢Gromacs最终攀上Desmond高峰 一、说明： 笔者在长期受到Amber、Gromacs模拟系统构建的折磨后，痛定思痛决定下载带有GUI美观、完全自动化、一键分析的D...
集群运行Numpy程序的测试实践与注意事项
你正确安装Numpy了吗？ 本测试主要使用的是某Numpy为底层的计算包，任务的核心在于求解矩阵对角化，使用的是LAPACK。计算的大头在于500次尺寸约为60000×60000的稀疏矩阵对角化...