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【综合】eScience服务协作与兼容报告

包含了一些eScience服务的综合信息

使用手册

超级计算

使用前请仔细阅读本手册

软件资源

超级计算

部分软件资源

硬件资源

超级计算

计算存储等所有硬件资源详情

云盘功能简介

云盘

一些关于云盘可以干什么的简单介绍,详细使用请移步下方教程~

测试报告

超级计算

【龟速更新】云盘新手入门使用教程

云盘

充分利用云盘提高效率,你需要看这一份新手教程~

服务门户

超级计算

https://scc.nju.edu.cn

表格模板使用教程

协同表格

一些表格模板的使用教程都在这里啦

数据同步与备份

LaTeX

常见问题与解答

云盘

💡💡💡💡💡💡💡💡💡 查阅提示:在手机移动端阅读本文档,请在顶部点击 “信息” 查看目录导航。 ❌特别提示:在电脑上,桌面端(Seafile) 与 挂载盘(SeaDrive) 是二选一的客户端,不需要同时安装,更不要使用桌面端同步挂载盘缓存目录。新手更推荐 直接使用桌面端(Seafile)。此外,在资料库、设备名(尤其是手机)等各种地方请避免使用emoji表情符号,由于编码问题可能会带来各种意料之外的问题。 💡💡💡💡💡💡💡💡💡 云盘相关信息 服务起源 2017年底,在2011计划的支持下,人工微结构科学与技术协同创新...

远程登录

超级计算 使用手册

登录方式 远程控制-登录方式 参考上述远程控制-登录方式链接内容,并合并覆盖以下内容: 账号密码 账号:集群用户名 密码:集群密码 Web Web支持图形界面xfwd、命令行界面ssh,文件传输sftp SSH Username: 输入集群用户名/10.1.0.101/self(如用户名是yaoge,则输入yaoge/10.1.0.101/self) SFTP Username: 输入集群用户名/10.1.0.101/self(如用户名是yaoge,则输入yaoge/10.1.0.101/self) ...

提交作业

超级计算 使用手册

集群使用作业调度系统管理所有计算作业,该系统接受用户的作业请求,并将作业合理的分配到合适的节点上运行,因此所有用户均应通过作业调度系统提交计算作业,不可直接在任何节点上直接运行。用户使用bsub命令向作业调度系统提交作业,bsub选项非常繁多,可对作业进行非常细致的控制,这里简要介绍常用选项和方法。 bsub 使用方式 命令行方式 bsub [options] command [arguments] [options] 为 bsub 的选项,可以设定队列、CPU核数等 command 为计算程序,如果是 MP...

集成云盘

超级计算 使用手册

独立账号 高性能计算集群用户可以使用集群账号直接登录云盘,用户名为集群账号@hpc.nju.edu.cn,密码即集群账号密码;如集群账号为yaoge,用户名填写yaoge@hpc.nju.edu.cn。首次使用需要登录网页端激活账号,但集群账号不能使用云盘的上下传外链功能。 云盘上的集群账号与南京大学统一身份认证账号相互独立,如集群账号yaoge@hpc.nju.edu.cn和南京大学统一身份认证账号0102003是两个完全独立的账号,需要分别激活才能使用。 文件同步 通过云盘的多平台多终端同步功能,可将集群中的目...

海量作业

超级计算 使用手册

作业组 为了便于管理海量的作业,可以对作业定义作业组。 作业组的名字是类似于Linux的路径名的树状结构,如作业组 /test ,而 /test/1 和 /test/2 都属于 /test 需要注意的是作业组是全局的,创建者是这个作业组的拥有者,作业组拥有者可以对这个作业组及其子组内的所有作业进行控制(哪怕这个作业是其他人提交的,拥有者也能进行控制)。如果您不想作业被别人控制,请确保提交到的作业组从/开始拥有者都是自己。 创建作业组 bgadd /test #显式创建作业组 bsub -g /test #使用bs...

控制作业

超级计算 使用手册

常用控制命令 命令 功能 bjobs 查看自己未结束的作业 bjobs -l JOBID 查看某个未结束作业的详情 bhist 查看自己已结束的历史作业 bhist -l JOBID 查看某个已结束历史作业的详情 bpeek JOBID 查看正在运行某个作业的stdout/stderr bkill JOBID 终止某个作业 btop JOBID 设置作业最先运行 bbot JOBID 设置作业最后运行 作业等待 bwait -w "wait_condition" [-...

查看信息

超级计算 使用手册

查看队列 查看所有队列:bqueues $ bqueues QUEUE_NAME PRIO STATUS MAX JL/U JL/P JL/H NJOBS PEND RUN SUSP x7542! 50 Open:Active - - - - 24 0 24 0 e5645! 50 Open:Active - - - - 0 0 ...

容器化

超级计算 使用手册

容器技术 容器技术能够对应用及其整个运行时环境(包括全部所需文件)一起进行打包或隔离。从而可以在不同环境(如开发、测试和生产等环境)之间轻松迁移应用,同时还可保留应用的全部功能。有了容器不再需要管理员为你安装任何东西。容器是一个独立的系统,你可以在里面做任何想做的事情。 Apptainer 2021年11月,Singularity 开源项目加入 Linux 基金会,并更名为 Apptainer。Apptainer 是一套类似于 Docker 的容器解决方案,是用于HPC容器系统。Apptainer 兼容 Singu...

常见问题

超级计算 使用手册

网络 登录节点进行网络接入认证 集群中的登录节点进行网络接入认证后即可访问互联网,认证后登录节点所有用户均可访问互联网,请注意网络安全!。 命令行登录和登出p.nju.edu.cn的方法有: curl -X POST https://p.nju.edu.cn/api/portal/v1/login -H "Content-type: application/json" -d '{"username":"<username>","password":"<password>"}' curl -X POST https:...

NVIDIA

超级计算 软件资源

CUDA Toolkit Name Path Module CUDA Toolkit 12.3.1 /fs00/software/cuda/12.3.1 cuda/12.3.1 CUDA Toolkit 12.0.0 /fs00/software/cuda/12.0.0 cuda/12.0.0 CUDA Toolkit 11.8.0 /fs00/software/cuda/11.8.0 cuda/11.8.0 CUDA Toolkit 11.2.0 /fs00/software/cuda/...

指引

超级计算

欢迎您使用e-Science中心的超算服务 高性能计算集群提供了安全多样的远程登录方法,使用 SFTP、ZMODEM、云盘等多种方式可以进行数据传输。集群已集成云盘便捷同步和备份数据,如数据量巨大可采用移动存储直接进行数据拷贝,主要文件数据请自行备份!注意查看组和用户的的存储配额情况,满了就无法写入数据了。 禁止在登录节点或计算节点直接运行计算程序,用户必须通过作业调度系统提交作业并控制作业,通过容器化技术可以在完全自主和隔离的环境中运行程序。海量作业需要进行优化以便管理,查看信息可见作业调度和集群等整体情况。 集...

服务节点

超级计算 硬件资源

管理、监控、认证、调度、备份和登录节点均为虚拟机,CPU/RAM/HDD根据需求分配 CPU: Intel Xeon E5-2680 v3 (12 Cores, 30MB Cache, 2.50 GHz, 9.6 GT/s QPI) RAM: 4 Channels, DDR4-2133 ECC RDIMM, Bandwidth: 136 GB/s Storage: Huawei Oceanstor 5500 V3, 2.5-inch 10Krpm SAS 和 2.5-inch SSD SAS 自动分层 Netwo...

通讯网络

超级计算 硬件资源

服务网络:100Mb/1Gb Ethernet 管理网络:1/10/25/40/100Gb Ethernet 高速网络:20/40/56/100/200Gb DDR/QDR/FDR/HDR InfiniBand, 100Gb Omni-Path Architecture

计算资源

超级计算 硬件资源

命名规则和优先级 每组计算节点均对应两个队列;标准队列和优先队列 标准队列(CPU和加速卡型号+网络类型):所有用户都可以提交作业到这个队列进行计算; 优先队列(CPU和加速卡型号+网络类型+!): 公共设备的优先队列:仅用于测试用途,优先级高于标准队列,但运行时间、作业数量、核数都有限制,没有抢占。 自购设备的优先队列:只允许队列购置者提交作业,优先!队列的作业如果因为资源不足而不能运行,则会抢占标准队列作业的资源,将标准队列的作业挂起(状态SSUSP)或杀掉,腾出资源来运行优先!队列的作业,当作业完成后被挂...

PyPI (Python Package Index)

私服仓库

Python 包索引(PyPI)是 Python 编程语言的软件存储库。南大源采用了阿里云,腾讯云和官方源的混合代理形式。 pip 配置指南 临时使用 pip install -i https://repo.nju.edu.cn/repository/pypi/simple [packageName] 使用此命令可以临时使用南大源下载指定包。 设置为默认源 如果想将南大源设置为默认源,则可能需要先更新 pip 版本: pip install pip -U # 更新 pip 版本 pip config set gl...

存储资源

超级计算 硬件资源

表格 类型 路径 容量 元数据 数据 快照创建时间点 快照保留策略 并行存储 /bbfs 117 TiB NVMe SSD NVMe SSD - - 并行存储 /fsa 361 TiB SAS SSD 7.2Krpm HDD 每日0时 每天快照保留7天每周快照保留2周 并行存储 /fs04 14 TiB 10Krpm HDD 10Krpm HDD 并行存储 /fs08 14 TiB 10Krpm HDD 10Krpm HDD 每日0时 每天快照保留3天 并行存储 /fs09 24 ...

Intel

超级计算 软件资源

Intel oneAPI Name Path MODULEPATH Intel oneAPI Base Toolkit 2024.0.1Intel HPC Toolkit 2024.0.1 /fs00/software/intel/oneapi2024.0 /fs00/software/modulefiles/oneapi/2024.0 Intel Parallel Studio Name Path Module Intel Parallel Studio XE 2020 Upda...

GNU

超级计算 软件资源

GNU Compiler Collection Name Path Module GNU Compiler Collection (GCC) 12.1.0 & GNU Binutils 2.38 /fs00/software/gcc/12.1.0 gcc/12.1.0 GNU Compiler Collection (GCC) 11.3.0 & GNU Binutils 2.36.1 /fs00/software/gcc/11.3.0 gcc/11.3.0 GNU Compiler Colle...

AMD

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AMD Optimizing C/C++ Compiler Name Path Module AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.3.0 (AOCC) /fs00/software/aocc/2.3.0 aocc/2.3.0 AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.1.0 (AOCC) /fs00/software/aocc/2.1.0 aocc/2.1.0 AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.0.0 (AOCC)...

Python

超级计算 软件资源

请使用者自行解决License问题,本中心概不负责! Anaconda Name Path Module Anaconda 3 (Python3) Latest /fs00/software/anaconda/3 anaconda/3 Anaconda 2 (Python2) Latest /fs00/software/anaconda/2 anaconda/2 Anaconda 5.0.1 (Python 3.6) /fs00/software/anaconda/3-5.0.1 anacon...