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常见问题

作业运行时实际占用CPU核数过多

在作业中限定使用的CPU核数与申请核数相同,或者尝试在提交作业时添加如下参数

#BSUB -R affinity[core:cpubind=core:membind=localprefer:distribute=pack]

特别是Python,有些Python包会自动满核并行的,需要使用环境变量(如 OMP_NUM_THREADS)等方式设定线程数。如果实在不行可以 #BSUB -x 独占节点运行作业。

登录节点登录网络

/fs00/software/bin/pnju -u <username> -p <password> -i		#登录网络
/fs00/software/bin/pnju -o									#登出网络

curl -s "http://p.nju.edu.cn/portal_io/login?username=<username>&password=<password>"	#登录网络
curl -s http://p.nju.edu.cn/portal_io/logout											#登出网络

pip安装包到自己的目录下

Python的大多数包不需要root权限也能安装,只需在pip install后加-t指定安装目录即可,如:

cd scikit-opt-master
pip install -t $HOME .

这样就装到自己的家目录下。在~/.bashrc里或者作业脚本中加上环境变量

export PYTHONPATH=$HOME:$PYTHONPATH