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常见问题与解答
查阅提示:在手机移动端阅读本文档,请在顶部点击 “信息” 查看目录导航。 ❌特别提示:在电脑上,桌面端(Seafile) 与 挂载盘(SeaDrive) 是二选一的客户端,不需要同时安装,更不要使用桌面端同步挂载盘缓存目录。新手更推荐 直接使用桌面端(Seafile)。此外,在资料库、设备名(尤其是手机)等各种地方请避免使用emoji表情符号,由于编码问题可能会带来各种意料之外的问题。 云盘相关信息 服务起源 2017年底,在2011计划的支持下,人工微结构科学与技术协同创新中心开始建设云盘,一直不断扩大服务范围,...
远程登录
登录方式 远程控制-登录方式 请务必首先仔细阅读上述远程控制-登录方式内容,并合并覆盖以下内容: 登录节点信息 Hostname IP OS Scheduler login1 10.1.0.101 CentOS 7 LSF login2 10.1.0.102 Rocky 9 Slurm login9 10.1.0.109 Rocky 9 LSF 账号密码 账号:集群用户名 密码:集群密码 Web Web支持图形界面xfwd、命令行界面ssh,文件传输sftp SSH Username: 输入集群用户名 或 集群用户...
提交作业
集群使用作业调度系统管理所有计算作业,该系统接受用户的作业请求,并将作业合理的分配到合适的节点上运行,因此所有用户均应通过作业调度系统提交计算作业,不可直接在任何节点上直接运行。 Slurm 在 Slurm 中, sbatch 用于提交批处理作业; srun 用于启动作业步骤,通常用于运行并行程序,也可用于启动交互式任务。 Slurm 作业提交方式 批处理作业方式 (sbatch) sbatch 用于提交批处理作业。用户将资源需求、环境配置和任务执行命令写入脚本,通过 sbatch 提交,由 Slurm 调度系统...
集成云盘
独立账号 高性能计算集群用户可以使用集群账号直接登录云盘,用户名为集群账号@hpc.nju.edu.cn,密码即集群账号密码;如集群账号为yaoge,用户名填写yaoge@hpc.nju.edu.cn。首次使用需要登录网页端激活账号,但集群账号不能使用云盘的上下传外链功能。 云盘上的集群账号与南京大学统一身份认证账号相互独立,如集群账号yaoge@hpc.nju.edu.cn和南京大学统一身份认证账号0102003是两个完全独立的账号,需要分别激活才能使用。 文件同步 通过云盘的多平台多终端同步功能,可将集群中的目...
海量作业
作业组 为了便于管理海量的作业,可以对作业定义作业组。 作业组的名字是类似于Linux的路径名的树状结构,如作业组 /test ,而 /test/1 和 /test/2 都属于 /test 需要注意的是作业组是全局的,创建者是这个作业组的拥有者,作业组拥有者可以对这个作业组及其子组内的所有作业进行控制(哪怕这个作业是其他人提交的,拥有者也能进行控制)。如果您不想作业被别人控制,请确保提交到的作业组从/开始拥有者都是自己。 创建作业组 bgadd /test #显式创建作业组 bsub -g /test #使用bs...
控制作业
Slurm 常用控制命令 命令 功能 squeue --me (或 squeue -u $USER) 查看自己正在排队或运行的未结束作业 scontrol show job JOBID 查看某个未结束作业的详细配置(如分配节点、环境变量、资源限制等) sacct 查看自己历史作业的简要信息 sacct -j JOBID -l 查看某个已结束历史作业的详细统计信息(包括内存峰值、CPU使用效率、退出状态等) tail -f slurm-JOBID.out 查看正在运行作业的标准输出(注:Slurm 没有直接对应的 ...
查看信息
Slurm 查看队列 查看所有分区: sinfo $ sinfo PARTITION AVAIL TIMELIMIT NODES STATE NODELIST e5v3ib up infinite 19 alloc f01n[01-04],f02n[04-06,13-14],f05n[05-14] e5v3k40ib up infinite 1 idle x001 e7v4ib up infinite 1 alloc...
容器化
容器技术 容器技术能够对应用及其整个运行时环境(包括全部所需文件)一起进行打包或隔离。从而可以在不同环境(如开发、测试和生产等环境)之间轻松迁移应用,同时还可保留应用的全部功能。有了容器不再需要管理员为你安装任何东西。容器是一个独立的系统,你可以在里面做任何想做的事情。 Apptainer 2021年11月,Singularity 开源项目加入 Linux 基金会,并更名为 Apptainer。Apptainer 是一套类似于 Docker 的容器解决方案,是用于HPC容器系统。Apptainer 兼容 Singu...
常见问题
网络 登录节点进行网络接入认证 在登录节点登录校园网账号 集群中的登录节点进行网络接入认证(即登入南京大学校园网认证 p.nju.edu.cn)后才可访问互联网,认证后登录节点所有用户均可访问互联网(相当于整个登录节点共享),请注意网络与账号隐私安全! 命令行登录和登出 p.nju.edu.cn的方法有: curl -X POST https://p.nju.edu.cn/api/portal/v1/login -H "Content-type: application/json" -d '{"username":...
NVIDIA
CUDA Toolkit Name Path Module CUDA Toolkit 12.3.1 /fs00/software/cuda/12.3.1 cuda/12.3.1 CUDA Toolkit 12.0.0 /fs00/software/cuda/12.0.0 cuda/12.0.0 CUDA Toolkit 11.8.0 /fs00/software/cuda/11.8.0 cuda/11.8.0 CUDA Toolkit 11.2.0 /fs00/software/cuda/...
指引
欢迎您使用e-Science中心的超算服务 高性能计算集群提供了安全多样的远程登录方法,使用 SFTP、ZMODEM、云盘等多种方式可以进行数据传输。集群已集成云盘便捷同步和备份数据,如数据量巨大可采用移动存储直接进行数据拷贝,主要文件数据请自行备份!注意查看组和用户的的存储配额情况,满了就无法写入数据了。 禁止在登录节点或计算节点直接运行计算程序,用户必须通过作业调度系统提交作业并控制作业,通过容器化技术可以在完全自主和隔离的环境中运行程序。海量作业需要进行优化以便管理,查看信息可见作业调度和集群等整体情况。 集...
服务节点
管理、监控、认证、调度和登录节点均为虚拟机,CPU/RAM/SSD根据需求分配 CPU: Intel Xeon Platinum 8358 (32 Cores, 48MB Cache, 2.60 GHz, 11.2 GT/s UPI) RAM: 8 Channels, DDR4-3200 ECC RDIMM, Bandwidth: 204.8 GB/s Storage: Huawei OceanStor Dorado 5500 V6 All-Flash Storage (NVMe over RoCE) Netwo...
通讯网络
骨干以太网:2*100Gb 服务网络:100Mb/1Gb Ethernet 管理网络:1/10/25/40/100Gb Ethernet 高速网络:40/56/100/200Gb QDR/FDR/HDR InfiniBand, 100Gb Omni-Path Architecture
计算资源
命名规则和优先级 每组计算节点均对应两个队列;标准队列和优先队列 标准队列(CPU和加速卡型号+网络类型):所有用户都可以提交作业到这个队列进行计算; 优先队列(CPU和加速卡型号+网络类型+!): 公共设备的优先队列:仅用于测试用途,优先级高于标准队列,但运行时间、作业数量、核数都有限制,没有抢占。 自购设备的优先队列:只允许队列购置者提交作业,优先!队列的作业如果因为资源不足而不能运行,则会抢占标准队列作业的资源,将标准队列的作业挂起(状态SSUSP)或杀掉,腾出资源来运行优先!队列的作业,当作业完成后被挂起的...
存储资源
合计 总容量:4.61 PiB 总览 高速全闪:bbfs 家目录:fsb、fs04、fs08、fs09、fs10、fs12、fs13、fs14 支撑目录:fs00 归档存储:/archive 表格 查看表格 并行存储 高速全闪(Tier 0) 特点:热数据、高性能 /bbfs 采用全NVMe SSD构建的高性能Burst Buffer,具备极高的顺序和随机读写性能,无快照。 文件系统:bbfs 购置者:公共共享100% 可用容量:116.4 TiB IO节点:4*HPE ProLiant DL380 G...
Intel
Intel oneAPI Name Path MODULEPATH Intel oneAPI Base Toolkit 2024.0.1Intel HPC Toolkit 2024.0.1 /fs00/software/intel/oneapi2024.0 /fs00/software/modulefiles/oneapi/2024.0 Intel Parallel Studio Name Path Module Intel Parallel Studio XE 2020 Upda...
GNU
GNU Compiler Collection Name Path Module GNU Compiler Collection (GCC) 12.1.0 & GNU Binutils 2.38 /fs00/software/gcc/12.1.0 gcc/12.1.0 GNU Compiler Collection (GCC) 11.3.0 & GNU Binutils 2.36.1 /fs00/software/gcc/11.3.0 gcc/11.3.0 GNU Compiler Colle...
AMD
AMD Optimizing C/C++ Compiler Name Path Module AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.3.0 (AOCC) /fs00/software/aocc/2.3.0 aocc/2.3.0 AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.1.0 (AOCC) /fs00/software/aocc/2.1.0 aocc/2.1.0 AMD Optimizing C/C++ Compiler 2.0.0 (AOCC)...