Gromacs

Gromacs-2018.8

Gromacs-2018.8使用CPU计算成键相互作用，使用GPU计算非键相互作用。

编译环境：

gcc/7.4.0
cmake/3.16.3
ips/2017u2
fftw/3.3.7-iccifort-17.0.6-avx2
cuda/10.0.130

软件信息：

GROMACS version:    2018.8                                                                                                                         Precision:          single                                                                                                                         Memory model:       64 bit                                                                                                                         MPI library:        MPI                                                                                                                             OpenMP support:     enabled (GMX_OPENMP_MAX_THREADS = 64)                                                                                           GPU support:        CUDA                                                                                                                           SIMD instructions:  AVX2_256                                                                                                                       FFT library:        fftw-3.3.7-avx2-avx2_128                                                                                                       CUDA driver:        11.40                                                                                                                           CUDA runtime:       10.0 

测试算例：

ATOM  102808(464 residues, 9nt DNA, 31709 SOL, 94 NA, 94 CL)
nsteps      = 25000000     ;50 ns

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