控制作业

常用控制命令

命令	功能
bjobs	查看自己未结束的作业
bjobbjobs -l JOBID	查看某个未结束作业的详情
bhist	查看自己已结束的历史作业
bhist -l JOBID	查看某个已结束历史作业的详情
bpeek JOBID	查看正在运行某个作业的stdout/stderr
bkill JOBID	终止某个作业
btop JOBID	设置作业最先运行
bbot JOBID	设置作业最后运行

作业依赖

一个计算任务可能分成几步，而每一步对资源的需求不同，因此需要分开提交，但这些作业之间又具有依赖关系，bsub 可使用选项 -w 'dependency_expression'指定依赖关系。如果计算任务分成几步，但是每步对资源需求一样，那么请写在一个作业任务中依次执行。

• -w 'done(job_ID | "job_name")'：需要 job_ID 或 job_name 作业完成且状态为 DONE，即退出码为0
• -w 'ended(job_ID | "job_name")'：需要 job_ID 或 job_name 作业完成或退出，状态为 EXIT 或 DONE
• 支持逻辑表达式&& (AND)、|| (OR)、! (NOT)
• 孤儿作业（即依赖条件不可能满足的）1分钟后会被自动终止

更多详细信息见官方文档

作业等待

bwait -w "wait_condition" [-t timeout]

暂停并等待作业条件满足，不满足一直暂停等待，满足则执行完毕返回。

典型用法：在脚本中不要循环使用bjobs判断作业状态，而用bwait等待作业运行完成，这样更优雅且能显著降低对集群的压力。

• -w wait_condition：要满足的等待条件，此表达式与上述bsub -w选项的格式相同。
• -t timeout：等待条件的超时，范围为1-525600分钟，默认为一年。